Mỗi một doanh nghiệp đều phải thực hiện việc và cuối mỗi năm phải thực hiện quyết toán thuế đối với cơ quan thuế có thẩm quyền. Bộ Tài chính có quy định về thời hạn nộp kê khai thuế và quyết toán thuế cụ thể như sau:

1. Về thời hạn nộp hồ sơ khai thuế:

- Nộp hồ sơ khai thuế theo tháng: Các doanh nghiệp thực hiện kê khai thuế theo tháng thì nộp hồ sơ khai thuế tới cơ quan thuế chậm nhất là ngày thứ 20 của tháng tiếp theo tháng phát sinh nghĩa vụ thuế.

- Nộp hồ sơ khai thuế theo quý:  Các doanh nghiệp thực hiện kê khai thuế theo quý thì nộp hồ sơ khai thuế tới cơ quan thuế chậm nhất là ngày thứ 30 của quý tiếp theo quý phát sinh nghĩa vụ thuế.

- Nộp hồ sơ khai thuế cả năm: Các doanh nghiệp nộp hồ sơ khai thuế cả năm tới cơ quan thuế chậm nhất là ngày thứ 30 của tháng đầu tiên của năm dương lịch hoặc năm tài chính.

- Nộp hồ sơ khai thuế theo từng lần phát sinh: Người nộp thuế phải nộp hồ sơ khai thuế chậm nhất là ngày thứ 10, kể từ ngày phát sinh nghĩa vụ thuế.

- Đối với nộp hồ sơ quyết toán thuế năm: Thời hạn nộp hồ sơ quyết toán thuế năm chậm nhất là ngày thứ 90, kể từ ngày kết thúc năm dương lịch hoặc năm tài chính.

- Nộp hồ sơ quyết toán thuế đối với trường hợp chấm dứt hoạt động, chấm dứt hợp đồng, chuyển đổi hình thức sở hữu doanh nghiệp hoặc tổ chức lại doanh nghiệp chậm nhất là ngày thứ 45, kể từ ngày phát sinh các trường hợp đó.

- Nộp hồ sơ khai thuế, thu khác liên quan đến sử dụng đất theo cơ chế một cửa liên thông thì thực hiện theo thời hạn quy định tại văn bản hướng dẫn liên ngành về cơ chế một cửa liên thông đó.

2. Trường hợp do một số những điều kiện khách quan khiến cho các đối tượng thuế không thể nộp hồ sơ kê khai thuế và quyết toán thuế đúng hạn. Nếu như thuộc các trường hợp mà pháp luật đã quy định được phép gia hạn nộp hồ sơ khai thuế và quyết toán thuế thì có thể gia hạn thêm thời gian nộp như sau:

- Người nộp thuế không có khả năng nộp hồ sơ khai thuế đúng hạn do thiên tai, hoả hoạn, tai nạn bất ngờ thì được thủ trưởng cơ quan thuế quản lý trực tiếp gia hạn nộp hồ sơ khai thuế.

-Thời gian gia hạn không quá 30 ngày kể từ ngày hết thời hạn phải nộp hồ sơ khai thuế đối với việc nộp hồ sơ khai thuế tháng, khai thuế năm, khai thuế tạm tính theo quý, khai thuế theo từng lần phát sinh nghĩa vụ thuế; 60 ngày kể từ ngày hết thời hạn phải nộp hồ sơ khai thuế đối với việc nộp hồ sơ khai quyết toán thuế.

- Người nộp thuế phải gửi đến cơ quan thuế nơi nhận hồ sơ khai thuế văn bản đề nghị gia hạn nộp hồ sơ khai thuế trước khi hết hạn nộp hồ sơ khai thuế, trong đó nêu rõ lý do đề nghị gia hạn có xác nhận của Uỷ ban nhân dân xã, phường, thị trấn hoặc công an xã, phường, thị trấn nơi phát sinh trường hợp được gia hạn nộp hồ sơ khai thuế.

- Trong thời hạn 5 ngày làm việc, kể từ ngày nhận được văn bản đề nghị gia hạn nộp hồ sơ khai thuế, cơ quan thuế phải trả lời bằng văn bản cho người nộp thuế về việc chấp nhận hay không chấp nhận việc gia hạn nộp hồ sơ khai thuế; nếu cơ quan thuế không có văn bản trả lời thì coi như đề nghị của người nộp thuế được chấp nhận.